Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne5Q8JZW4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms