Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hpf1Q8CFE2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms