Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28aQ8CEI3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28aQ8CEI3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28aQ8CEI3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28aQ8CEI3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28aQ8CEI3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc28aQ8CEI3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc28aQ8CEI3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc28aQ8CEI3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc28aQ8CEI3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc28aQ8CEI3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc28aQ8CEI3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc28aQ8CEI3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc28aQ8CEI3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc28aQ8CEI3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc28aQ8CEI3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms