Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Usp27Q8CEG8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Usp27Q8CEG8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Usp27Q8CEG8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Usp27Q8CEG8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Usp27Q8CEG8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Usp27Q8CEG8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp27Q8CEG8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp27Q8CEG8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp27Q8CEG8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp27Q8CEG8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp27Q8CEG8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp27Q8CEG8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp27Q8CEG8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp27Q8CEG8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp27Q8CEG8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp27Q8CEG8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp27Q8CEG8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Usp27Q8CEG8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Usp27Q8CEG8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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