Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc178Q8CDV0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms