Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc87Q8CDL9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc87Q8CDL9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms