Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Riox2Q8CD15 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms