Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps53Q8CCB4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps53Q8CCB4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms