Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A430089I19RikQ8C9W1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A430089I19RikQ8C9W1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms