Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfibp1Q8C8U0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms