Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms