Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CrbnQ8C7D2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CrbnQ8C7D2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CrbnQ8C7D2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms