Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc60Q8C4J0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc60Q8C4J0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms