Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rft1Q8C3B8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rft1Q8C3B8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms