Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Catsper4Q8BVN3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Catsper4Q8BVN3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms