Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6kb1Q8BSK8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6kb1Q8BSK8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6kb1Q8BSK8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6kb1Q8BSK8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6kb1Q8BSK8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6kb1Q8BSK8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6kb1Q8BSK8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6kb1Q8BSK8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6kb1Q8BSK8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6kb1Q8BSK8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6kb1Q8BSK8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps6kb1Q8BSK8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kb1Q8BSK8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms