Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjd4Q8BSD4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjd4Q8BSD4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjd4Q8BSD4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms