Protein–RNA interactions for Protein: Q8BN59

Larp6, La-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp6Q8BN59 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Larp6Q8BN59 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Larp6Q8BN59 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Larp6Q8BN59 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Larp6Q8BN59 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Larp6Q8BN59 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Larp6Q8BN59 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Larp6Q8BN59 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Larp6Q8BN59 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Larp6Q8BN59 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Larp6Q8BN59 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp6Q8BN59 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp6Q8BN59 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms