Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap4Q8BMK4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap4Q8BMK4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ckap4Q8BMK4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap4Q8BMK4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap4Q8BMK4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap4Q8BMK4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap4Q8BMK4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap4Q8BMK4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap4Q8BMK4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms