Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnrc6bQ8BKI2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnrc6bQ8BKI2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms