Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d3Q8BJ83 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tm2d3Q8BJ83 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms