Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf41Q8BH75 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf41Q8BH75 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf41Q8BH75 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms