Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms