Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Liat1Q810M6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Liat1Q810M6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms