Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem39bQ810L4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms