Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChfrQ810L3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ChfrQ810L3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193 ms