Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg2bQ80XK6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg2bQ80XK6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms