Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Jph4Q80WT0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Jph4Q80WT0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms