Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cul9Q80TT8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul9Q80TT8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms