Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms