Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clec18aQ7TSQ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec18aQ7TSQ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec18aQ7TSQ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms