Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccp110Q7TSH4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms