Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf516Q7TSH3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf516Q7TSH3 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms