Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2aQ7TSC1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms