Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2lQ7TS74 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2lQ7TS74 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms