Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actn1Q7TPR4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actn1Q7TPR4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms