Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ShprhQ7TPQ3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ShprhQ7TPQ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ShprhQ7TPQ3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ShprhQ7TPQ3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ShprhQ7TPQ3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ShprhQ7TPQ3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ShprhQ7TPQ3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ShprhQ7TPQ3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ShprhQ7TPQ3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ShprhQ7TPQ3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ShprhQ7TPQ3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ShprhQ7TPQ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.6 ms