Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prrc2bQ7TPM1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prrc2bQ7TPM1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms