Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HhipQ7TN16 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms