Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl2Q78Y63 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms