Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msrb2Q78J03 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msrb2Q78J03 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms