Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK4

Apool, MICOS complex subunit Mic27, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoolQ78IK4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ApoolQ78IK4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApoolQ78IK4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApoolQ78IK4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApoolQ78IK4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApoolQ78IK4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApoolQ78IK4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApoolQ78IK4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ApoolQ78IK4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApoolQ78IK4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApoolQ78IK4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms