Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sned1Q70E20 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sned1Q70E20 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms