Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SpopQ6ZWS8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SpopQ6ZWS8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SpopQ6ZWS8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpopQ6ZWS8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms