Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nemp1Q6ZQE4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nemp1Q6ZQE4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.5 ms