Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ube2oQ6ZPJ3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2oQ6ZPJ3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2oQ6ZPJ3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms