Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPF4

Fmnl3, Formin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmnl3Q6ZPF4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fmnl3Q6ZPF4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fmnl3Q6ZPF4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fmnl3Q6ZPF4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms