Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sbf1Q6ZPE2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sbf1Q6ZPE2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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