Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Znf653Q6YND2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf653Q6YND2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms