Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms